Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms