Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms