Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BCO2Q9BYV7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms