Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSDMCQ9BYG8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms