Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms