Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TINF2Q9BSI4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms