Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM29Q9BSF4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms