Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MESP1Q9BRJ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms