Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms