Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGMNQ99538 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms