Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms