Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms