Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms