Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms