Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC43Q96MW1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms