Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNBD2Q96M20 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms