Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms