Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms