Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms