Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIRT1Q96EB6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms