Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms