Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms