Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRAT1Q92837 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms