Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms