Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTTNBP2Q8WZ74 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTTNBP2Q8WZ74 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms