Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf40Q8WZ69 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C11orf40Q8WZ69 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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