Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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