Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL11Q8NHH1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms