Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF248Q8NDW4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms