Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNBD1Q8NA66 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms