Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD53Q8N9V6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms