Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ANKRD35Q8N283 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms