Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF2Q8IX21 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms