Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTF1AQ7RTS3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms