Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH2Q76I76 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms