Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms