Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms