Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF493Q6ZR52 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms