Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms