Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KMT5B-209ENST00000441488 2816 ntTSL 1 (best)6.72□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FBXO38-207ENST00000504447 1716 ntTSL 36.61□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SARAF-211ENST00000522794 808 ntTSL 56.6□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 BCOR-211ENST00000490976 3480 ntTSL 26.58□□□□□ -1.368e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SHQ1-203ENST00000463369 2065 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.397e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CDC14B-205ENST00000415608 684 ntTSL 56.37□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)6.32□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ITSN1-223ENST00000465143 614 ntTSL 36.28□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 56.27□□□□□ -1.412e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.412e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 INTS10-212ENST00000522081 2333 ntTSL 26.21□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 36.1□□□□□ -1.438e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PCLAF-204ENST00000558043 689 ntTSL 26.01□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 EME1-210ENST00000514211 462 ntTSL 55.98□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KIAA1324L-201ENST00000394714 3073 ntTSL 55.93□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SHQ1-207ENST00000475558 666 ntTSL 55.86□□□□□ -1.472e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 RNF144A-204ENST00000433456 392 ntTSL 35.84□□□□□ -1.472e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)5.82□□□□□ -1.488e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.488e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 AGAP4-205ENST00000492347 413 ntTSL 55.77□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 MTFR2-201ENST00000367784 1586 ntTSL 25.76□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SACM1L-203ENST00000433336 678 ntTSL 35.69□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KPNB1-209ENST00000580158 603 ntTSL 25.68□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.518e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FBXW7-206ENST00000603821 4279 ntTSL 25.46□□□□□ -1.548e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 TMX2-205ENST00000528042 763 ntTSL 25.24□□□□□ -1.579e-11■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.572e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SEPT11-208ENST00000506731 659 ntTSL 55.21□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ENTPD1-AS1-208ENST00000451364 716 ntTSL 25.13□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 IFT80-223ENST00000487943 3893 ntTSL 25.07□□□□□ -1.62e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.62e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.612e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.622e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 IFT80-221ENST00000484963 382 ntTSL 54.89□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 XPNPEP1-202ENST00000369658 881 ntTSL 24.89□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-202ENST00000572415 796 ntTSL 24.68□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.672e-9■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 MOB1A-205ENST00000495286 741 ntTSL 34.59□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DDHD2-204ENST00000520176 3165 ntTSL 24.56□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 TMX2-209ENST00000533602 560 ntTSL 34.56□□□□□ -1.689e-11■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 AP1G1-204ENST00000562934 547 ntTSL 54.51□□□□□ -1.698e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FBXO38-209ENST00000505399 843 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-203ENST00000573087 851 ntTSL 34.44□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CCDC150-205ENST00000448409 2614 ntTSL 1 (best)4.44□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 WDR41-214ENST00000509858 461 ntTSL 34.37□□□□□ -1.712e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CCDC150-203ENST00000424427 2639 ntTSL 24.28□□□□□ -1.722e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ATAD2-206ENST00000530065 411 ntTSL 34.23□□□□□ -1.738e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 TMEM237-209ENST00000471318 828 ntTSL 34.21□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 COA1-207ENST00000420441 547 ntTSL 24.2□□□□□ -1.748e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CLDND1-213ENST00000506927 520 ntTSL 24.06□□□□□ -1.768e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.762e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.778e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.792e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CCDC150-215ENST00000487663 1392 ntTSL 1 (best)3.74□□□□□ -1.812e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CLDND1-228ENST00000513873 538 ntTSL 33.62□□□□□ -1.838e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 TRAPPC10-211ENST00000485621 537 ntTSL 23.58□□□□□ -1.842e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 WDHD1-205ENST00000567693 2348 ntTSL 23.52□□□□□ -1.855e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 BRWD3-202ENST00000473691 2829 ntTSL 23.33□□□□□ -1.882e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.892e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.892e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.912e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 INTS12-207ENST00000493425 644 ntTSL 23.04□□□□□ -1.922e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 GSKIP-206ENST00000555757 361 ntTSL 33.02□□□□□ -1.932e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DDHD2-215ENST00000528504 830 ntTSL 33.02□□□□□ -1.932e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 UBR1-208ENST00000569066 2250 ntTSL 1 (best)2.65□□□□□ -1.982e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 AGAP4-206ENST00000495243 340 ntTSL 22.63□□□□□ -1.992e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PDS5B-202ENST00000447833 906 ntTSL 42.57□□□□□ -22e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -22e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PTTG1-206ENST00000523659 851 ntTSL 22.54□□□□□ -22e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.012e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SSFA2-214ENST00000491866 718 ntTSL 52.46□□□□□ -2.022e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 IFT80-204ENST00000465537 860 ntTSL 52.42□□□□□ -2.022e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PIK3CB-211ENST00000485060 612 ntTSL 32.4□□□□□ -2.022e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DDHD2-222ENST00000532106 548 ntTSL 42.31□□□□□ -2.042e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 FOPNL-209ENST00000575938 381 ntTSL 32.26□□□□□ -2.052e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PIK3CB-203ENST00000462294 542 ntTSL 52.24□□□□□ -2.052e-12■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 IFT80-216ENST00000478460 591 ntTSL 42.2□□□□□ -2.062e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.062e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 INTS10-217ENST00000523846 704 ntTSL 32.18□□□□□ -2.062e-8■■■■■ 31.6
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 475.5 ms