Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms