Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms