Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM46CQ5VWP2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms