Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms