Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms