Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms