Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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C10orf55Q5SWW7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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