Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms