Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms