Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DCAF6Q58WW2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DCAF6Q58WW2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms